DADES IDENTIFICATIVES									2007_08
Assignatura	BIOINFORMÀTICA							Codi	205151214
Ensenyament	Nanociència i Nanotecnologia (2006)							Cicle	2on
Descriptors	Crèd.		Tipus	Curs	Període
	2.5		Optativa		Únic anual
Llengua d'impartició	Anglès Català
Departament	Bioquímica i Biotecnologia
Coordinador/a	PUJADAS ANGUIANO, GERARD				Adreça electrònica	gerard.pujadas@urv.cat
Professors/es	PUJADAS ANGUIANO, GERARD
Web	http://moodle.urv.cat
Descripció general i informació rellevant	Known the main bioinformatic's tools and understand how to use them to solve biologic problems.

Competències Tipus A Codi Competències Específiques   Recerca Tipus B Codi Competències Transversals   Recerca Tipus C Codi Competències Nuclears   Recerca Objectius d'aprenentatge Objectius Competències Conèixer les principals tècniques bioinformàtiques i saber-les emprar per resoldre problemes biològics. Continguts Tema Subtema 1. Introducció. Què és la bioinformàtica? Fonaments d'estructura d'àcids nucleics i de proteïnes. Genomes i proteomes. L'evolució a nivell molecular. Matrius de distància. Principals bases de dades d'àcids nucleics i proteïnes. Mineria de dades en bases de dades de biologia molecular: l'SRS. 2. Comparació de seqüències. Mesures de la semblança entre dues seqüències. Alineament de dues seqüències. Multialineament. Arbres filogenètics. Aplicació de la comparació de seqüències a la mineria de dades. 3. Anàlisi comparativa de genomes. Anàlisi i anotacio de genomes. Aplicació de la genòmica comparativa en la reconstrucció de vies metabòliques. 4. Relació estructura/funció en proteïnes. Fonaments de la determinació experimental de l'estructura proteica. La base de dades del PDB: mineria de dades en ella i anàlisi de la informació continguda en ella. Anàlisi de l'estructura proteica mitjançant software de visualització molecular. Relació estructura/evolució i correlació amb estructura/funció. Predicció de la funció. Docking. 5. Obtenció d'informació estructural en proteïnes d'estructura desconeguda. Predicció de l'estructura secundària. Predicció del plegament. Modelat per homologia. 6. Enginyeria de proteïnes. Propietats de les proteïnes susceptibles de ser millorades. Selecció de mutacions d'acord amb la propietat a millorar. Mutagènesi "in silico". 7. Introducció a la programació en lleguatge PERL. Conceptes bàsics del PERL. Disseny d'algoritmes bioinformàtics. Planificació Metodologies  ::  Proves   Competències (*) Hores a classe Hores fora de classe (**) Hores totals Activitats Introductòries 0 0 0     Atenció personalitzada 0 0 0     (*) En el cas de docència no presencial, són les hores de treball amb suport vitual del professor. (**) Les dades que apareixen a la taula de planificació són de caràcter orientatiu, considerant l’heterogeneïtat de l’alumnat Metodologies Metodologies   Descripció Activitats Introductòries Atenció personalitzada Descripció Avaluació   Descripció Pes   Altres comentaris i segona convocatòria Fonts d'informació Bàsica Complementària Recomanacions