IDENTIFYING DATA 2012_13
Subject (*) BIOQUÍMICA A LA NANOESCALA Code 20635259
Study programme
Nanociència i Nanotecnologia (2010)
Cycle 2n
Descriptors Credits Type Year Period Exam timetables and dates
5 Optativa Únic anual
Modality and teaching language
Department Enginyeria Química
Coordinator
CONSTANTÍ GARRIGA, MAGDALENA
E-mail magdalena.constanti@urv.cat
Lecturers
CONSTANTÍ GARRIGA, MAGDALENA
Web
General description and relevant information L'assignatura té com objectius Generals introduir a l’alumne els conceptes bàsics de bioquímica i biologia molecular i presentar a l’alumne el principis immediats i la seva estructura, fent especial èmfasi en aquelles molècules biològiques amb interès nanotecnològic

Competències
Type A Code Competences Specific
  Recerca
  AR18 Entendre l’expressió gènica, funció de l’ADN i els processos que se’n deriven.
  AR19 Entendre el paper de les proteïnes, enzims i anticossos en el cos humpa i com les propietats dels anticossos poden ser explotades per a ús terapèutic i en diagnòstics.
  AR21 Entendre la genòmica, transcriptòmica i proteòmica i les eines que són utilitzades per estudiar cada una d’elles.
Type B Code Competences Transversal
  Recerca
  BR2 Treballar de manera autònoma amb iniciativa.
  BR4 Capacitat d’organització i planificació.
  BR8 Capacitat d'apendre
  BR10 Habilitats crítiques: anàlisi i sintesi.
Type C Code Competences Nuclear
  Comú
  CC3 Comunicar-se de manera efectiva en la pràctica professional i com a ciutadà.
  CC4 Dominar l’expressió i la comprensió de, pel cap baix, un idioma estranger.

Objectius d'aprenentatge
Objectives Competences
Introduir a l'alumne els conceptes bàsics de bioquímica i biologia molecular AR18
AR19
AR21
BR2
BR4
Adquirir els principis immediats i la seva estructura, fent especial èmfasi en aquelles molècules biològiques amb interès nanotecnològic BR8
BR10
CC3
CC4

Continguts
Topic Sub-topic
1- General view of Biochemistry. Cellular, chemical and genetic fundamentals of live. Water. Glycids. Lipids. Nucleic acids.
2- Aminoacides, peptides and proteins. Amino acides. Peptide bond and primary structure. Three-dimensional structure of proteins. Folding and denaturalization.
3- Methods to study proteins. Purification and characterization. Determination of amino acidic sequence. Mass spectrometry. Determination of three-dimensional structure; X ray diffraction and nuclear magnetic resonance.
4- Enzymes. Enzymatic catalysis. Michaelis-Menten model. Allosteric enzymes. Enzymatic inhibition. Regulation of enzymatic activity. Catalytic strategies. General view of metabolism.
5- Biomembranes. Lipids as a biomembrane components. Proteins as a biomembrane components. Transport and energy transduction. Examples of biomembranes components: membrane transporters, potassium-sodium pump, ATPases, TMS transporters.
6- Nucleic acids. Composition and structure of DNA and RNA. Physic and chemical properties. Interactions between proteins and nucleic acids. Special nucleotides: TFOs, TFBs. Hairpins, aODNs, iRNAs, biological applications.
7- Methods to study nucleic acids. Electrophoresis. Nucleic acid hybridisation. Enzyme to handle nucleic acids. Polymerase chain reaction (PCR): fundamentals and applications. DNA sequencing. DNA cloning.
8- Micro arrays. Types. Construction: lithographic techniques. Applications: gene expression determination, genotyping, SNPs identification, specific binding to transcription factors, identification of protein interactions.

Planificació
Methodologies  ::  Tests
  Competences (*) Class hours Hours outside the classroom (**) Total hours
Activitats Introductòries
1 1 2
 
Sessió Magistral
20 40 60
Treballs
5 10 15
Presentacions / exposicions
7 14 21
 
Atenció personalitzada
8 0 8
 
Proves objectives de preguntes curtes
7 0 7
Proves de desenvolupament
6 6 12
 
(*) On e-learning, hours of virtual attendance of the teacher.
(**) The information in the planning table is for guidance only and does not take into account the heterogeneity of the students.

Metodologies
Methodologies
  Description
Activitats Introductòries Una sessió de presentació de l’assignatura on també es relacionen els conceptes bàsics que els alumnes hauríen de tenir adquirits.
Sessió Magistral Sessions de classe magistral on s’exposaran els continguts dels temes que componen l’assignatura. Les classes magistrals es realitzaran amb el recolzament de medis audiovisuals. Presentacions « power-point » amb videos i animacions.
Treballs Treball en profunditat d'un tema per part de l'alumne.
Aquests treballs tenen una relació directa amb els continguts impartits en les sessions magistrals. Resolució d'exercicis.
Presentacions / exposicions Exposició i defensa pública a classe d’un treball elaborat per l’alumne individualment o en grup.

Atenció personalitzada

Atenció personalitzada
 
Atenció personalitzada
Description
Reunions amb els alumnes bé individualment o en petits grups per tal de resoldre dubtes, indicar punts de millora i orientar en el desenvolupament general de l'assignatura

Avaluació
  Description Weight
Treballs Resolució d'exercicis 20%
Presentacions / exposicions Exposició i defensa pública a classe d’un treball elaborat per l’alumne individualment o en grup.
15%
Proves objectives de preguntes curtes Dues proves objectives al llarg del curs. (primera prova: 25%) i (segona prova: 40%) 65%
 
Other comments and second exam session

Fonts d'informació

Bàsica NELSON, COX, Lehninger Principles of Biochemistry., Worth Publishers, darrera edició
DEVLIN, T. M., Bioquímica, Ed. Reverté, darrera edició
LODISH, Harvey et al., Biología celular y molecular. , Editorial Médica Panamericana, darrera edició
LUQUE, J.; HERRAEZ, A., Biologia Molecular e Ingeniería Genética., Harcourt, darrera edició
McKEE, T., Bioquímica. La base molecular de la vida. , McGraw Hill/Interamericana, darrera edició
STRYER, L., Bioquímica., Reverté, darrera edició

Complementària

Recomanacions


(*)The teaching guide is the document in which the URV publishes the information about all its courses. It is a public document and cannot be modified. Only in exceptional cases can it be revised by the competent agent or duly revised so that it is in line with current legislation.