Guía docente 2018

DATOS IDENTIFICATIVOS

2018_19

Asignatura (*)

EPIGENÈTICA

Código

13214216

Titulación

Grau de Bioquímica i Biologia Molecular (2009)

Ciclo

Descriptores

Cr.totales

Tipo

Curso

Periodo

Optativa

Impartición

Modalidad por grupo de trabajo

Idioma de impartición, horarios y fechas de examen

Departamento

Bioquímica i Biotecnologia

Coordinador/a

ROMEU FIGUEROLA, ANTONIO RAMÓN

Correo-e

antoni.romeu@urv.cat

Profesores/as

ROMEU FIGUEROLA, ANTONIO RAMÓN

Web

Descripción general e información relevante

Objectiu de la epigenètica: Estudi de patrons d'expressió de gens (i el fenotip associat) estables i heretables, dependents de l'estructura de la cromatina i independents de canvis en la seqüència de l'ADN. La paraula epigenètica prové del grec antic epi–més, per sobre de, a més de, exterior a– i genèticos–genitiu– o gènesis–origen–. Mentre que la genètica és la ciència dels gens, l'herència i la diversitat dels organismes vius basada en les variacions a la seqüència de nucleòtids de l’ADN (base material dels gens), l’epigenètica és l'estudi dels canvis heretables en els patrons d’expressió dels gens – i dels fenotips cel•lulars associats a aquests patrons d’expressió– causats per mecanismes que no impliquen variacions a la seqüència de nucleòtids a l'ADN. En són exemples de mecanismes epigenètics la metilació de l'ADN i la modificació de les histones als nucleosomes, que es poden mantenir a través de divisions cel•lulars durant tota la vida d’un organisme i fins i tot poden perdurar diverses generacions. Un exemple de fenomen epigenètic és el procés de diferenciació cel•lular durant el desenvolupament embrionari: a partir d’un zigot s’originen primer cèl•lules mare totipotents, que desprès es diferencien en les diferents línies cel•lulars pluripotents de l'embrió, que al seu torn es convertiran en les diferents cèl•lules completament diferenciades a l’organisme adult. Múltiples factors ambientals, com ara la nutrició de la mare, poden afectar el desenvolupament de l’embrió i l’organisme adult a través de mecanismes epigenètics.

Competències

Tipo A	Código	Competencias Específicas
	A2	Descriure les bases bioquímiques, moleculars i estructurals del funcionament dels éssers vius.
	A4	Conèixer i comprendre de manera integrada els organismes a nivell molecular, cel·lular i metabòlic.
Tipo B	Código	Competencias Transversales
Tipo C	Código	Competencias Nucleares

Resultats d'aprenentage

Tipo A	Código	Resultados de aprendizaje
	A2	Conèixer els factors ambientals i nutricionals que afecten els processos epigenètics Conèixer els mecanismes epigenètics i la seva funció en la regulació de l'expressió gènica heretable Conèixer la rellevància dels processos epigenètics per al desenvolupament i la salut
	A4	Conèixer els factors ambientals i nutricionals que afecten els processos epigenètics Conèixer els mecanismes epigenètics i la seva funció en la regulació de l'expressió gènica heretable Conèixer la rellevància dels processos epigenètics per al desenvolupament i la salut
Tipo B	Código	Resultados de aprendizaje
Tipo C	Código	Resultados de aprendizaje

Continguts

tema	Subtema
1. Introducció	Camp d'estudi de la epigenètica: patrons d'expressió gènica estables i heretables, i els seus fenotips associats, dependents de l'estructura de la cromatina i independents de canvis en la seqüència de l'ADN. Exemples de fenòmens epigenètics: -Sacharomyces cerevisiae: mating-type switching!?. - Abelles reines, mascles i obreres. - Rèptils i peixos: plasticitat a la determinació del sexe. - Mamífers: inactivació del cromosoma X.
2. Mecanismes epigenètics.	• Metilació de l'ADN. • Modificacions d'histones. • Remodelació de cromatina dependent d'ATP. • Variants d'histones i ocupació del nucleosoma. • Proteïnes efectores que llegeixen les marques de histones. • ARNs petits no codificants: miRNA, siRNA, piRNA. • Metilació de l'ARN. • Prions.
3. Epigenètica del desenvolupament embrionari i diferenciació cel•lular.	• Proteïnes Polycomb i Trithorax • Caenorhabditis elegans • Drosophila melanogaster • Mamífers: especificació de destí cel•lular, llinatges cel•lulars i diferenciació de teixits • Perfil epigenètic de Cèl•lules Mare Embrionàries i reprogramació nuclear.
4. Determinació sexual i compensació de dosi gènica.	• Caenorhabditis elegans • Drosophila melanogaster • Peixos • Rèptils • Mamífers, inactivació del cromosoma X.
5. Empremta genòmica i Epigenètica transgeneracional en mamífers	• Herència epigenètica a través de la meiosi. • Reprogramació de marques epigenètiques en línies germinals. • Herència epigenètica materna i paterna. • Metilació diferencial de Regions de Control de Empremta. • Hipòtesi del conflicte genètic. • Rellevància d'herència epigenètica en malalties. • Aportació de l'epigenètica transgeneracional a l'evolució de les espècies.
6. Efectes epigenètics dependents de la Nutrició	• Abelles i formigues. • Mamífers: Efectes epigenètics de la dieta i els seus components en obesitat i diabetis. • Mamífers: Efectes de la nutrició i salut materna sobre marques epigenètiques, desenvolupament i salut dels fills.
7. Epigenètica i càncer.	• Lesions genètiques i epigenètiques en càncer. • Patrons anòmals de metilació de DNA i variants d’histones en càncer. • Alteracions genètiques en gens d'enzims modificadors d'histones. • Rol de microRNAs en càncer. • Telòmers i estabilitat de cromosomes en càncer.
8. Memòria epigenètica en plantes.	• Pluripotència de les cèl•lules vegetals. • Regulació de respostes a baixes temperatures per vernalització i aclimatació a fred.
9. Temes de discussió:	* Epigenètica en la Reproducció Assistida. * Epigenètica en la Medicina Regenerativa. * Epigenètica en la Clonació. * Epigenètica i aliments transgènics. * Epigenètica en espècies híbrides: mules i ligers.

Planificació

Metodologías :: Pruebas

Competencias

(*) Horas en clase

Horas fuera de clase

(**) Horas totales

Activitats Introductòries

Sessió Magistral

Atenció personalitzada

Proves mixtes

(*) En el caso de docencia no presencial, serán las horas de trabajo con soporte virtual del profesor.
(**) Los datos que aparecen en la tabla de planificación son de carácter orientativo, considerando la heterogeneidad de los alumnos

Metodologies

Metodologías

	descripción
Activitats Introductòries	Activitats encaminades a prendre contacte i a recollir informació dels alumnes i presentació de l'assignatura.
Sessió Magistral	Exposició dels continguts de l'assignatura.
Atenció personalitzada	Temps del professor reservat per atendre i resoldre dubtes als alumnes.

Atenció personalitzada

descripción

El professor atén i resol dubtes dels alumnes a classe o al despatx prèvia cita.

Avaluació

Metodologías

Competencias

descripción

Peso

Proves mixtes

Proves que combinen preguntes de desenvolupament, preguntes objectives de preguntes curtes, proves objectives tipus test i/o presentacions de treballs escrits i/o orals.

100%

Otros

Otros comentarios y segunda convocatoria

Cal obtenir un 4 en cada prova avaluadora per poder aprovar l'assignatura.

Segona convocatòria: cada prova es podrà recuperar en segona convocatòria de forma independent de les altres proves.

Durant les proves d'avaluació, els telèfons mòbils, tablets i altres aparells que no siguin expressament autoritzats per la prova, han d'estar apagats i fora de la vista.
${1}iLa realització demostrativament fraudulenta d'alguna activitat avaluativa d'alguna assignatura tant en suport material com virtual i electrònic comporta a l'estudiant la nota de suspens d'aquesta activitat avaluativa. Amb independència d'això, davant la gravetat dels fets, el centre pot proposar la iniciació d'un expedient disciplinari, que serà incoat mitjançant resolució del rector o rectora.${1}i

Fonts d'informació

Bàsica	Trygve Tollefsbol (Editor) , Handbook of Epigenetics: The New Molecular and Medical Genetics , 1, 2010 Craig and Wong (Editors), Epigenetics: A Reference Manual, 1, 2011 Robert A. Meyers (Editor), Epigenetic Regulation and Epigenomics, 1, 2012 Nilanjana Maulik, Gautam Maulik (Editors), Nutrition, Epigenetic Mechanisms, and Human Disease, 1, 2010 Sang-Woon Choi and Simonetta Friso (Editors) , Nutrients in Epigenetics, 1, 2009 Mihai D. Niculescu and Paul Haggarty (Editors), Nutrition in Epigenetics, 1, 2011 C. David Allis, Thomas Jenuwein, Danny Reinberg (Editors), Epigenetics, 1, 2008 Jorg Tost (Editor) , Epigenetics, 1, 2008

Complementària	Scott F. Gilbert and David Epel, ECOLOGICAL DEVELOPMENTAL BIOLOGY. Integrating Epigenetics, Medicine and Evolution. , 1, 2009 Trygve Tollefsbol (Editor), Cancer Epigenetics, 1, 2009 Frank Grosveld and Steven Henikoff (Editors), EPIGENETICS AND CHROMATIN, e-journal, http://www.epigeneticsandchromatin.com/, mensual, Oct 2008 - present , EPIGENOMICS, e-journal, mensual, Oct 2009 (Vol. 1, no. 1) - present (1 any de reta The University of Utah, http://learn.genetics.utah.edu/content/epigenetics/, , USA National Center for Biotechnology Information, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/epigenomics, ,

Recomanacions

Asignaturas que se recomienda haber cursado previamente

GENÈTICA/13214007

EXPRESSIÓ I REPLICACIÓ GÈNIQUES/13214102

GENÈTICA MOLECULAR I ENGINYERIA GENÈTICA/13214112

(*)La Guía docente es el documento donde se visualiza la propuesta académica de la URV. Este documento es público y no es modificable, excepto en casos excepcionales revisados por el órgano competente o debidamente revisado de acuerdo la normativa vigente.