IDENTIFYING DATA 2019_20
Subject (*) MOLECULAR GENETICS AND GENETIC ENGINEERING Code 13214112
Study programme
Bachelor's Degree in Biochemistry and Molecular Biology (2009)
Cycle 1st
Descriptors Credits Type Year Period
6 Compulsory Third 1Q
Language
Català
Department Biochemistry and Biotechnology
Coordinator
FERNÁNDEZ LARREA, JUAN BAUTISTA
E-mail juanbautista.fernandez@urv.cat
neus.martinez@urv.cat
marina.colom@urv.cat
Lecturers
FERNÁNDEZ LARREA, JUAN BAUTISTA
MARTÍNEZ MICAELO, NIEVES BEATRIZ
COLOM PELLICER, MARINA
Web
General description and relevant information Organization of genetic information in DNA sequences. Basic knowledge of recombinant DNA technology and its applications for the manipulation of genomes and gene expression in prokaryotic and eukaryotic organisms.

Competences
Type A Code Competences Specific
 CE10 Appreciate the complexity and diversity of organisms through the study of their molecules, cells, physiological processes, genetics and evolution.
 CE11 Appreciate the speed of potential changes in Biochemistry.
Type B Code Competences Transversal
Type C Code Competences Nuclear

Learning outcomes
Type A Code Learning outcomes
 CE10 Comprendre com els oncògens són capaços d'iniciar creixement tumoral.
Comprendre el significat biològic dels processos de reparació i recombinació del DNA i la seva importància en l'evolució dels genomes
Conéixer com està organitzada la informació al genoma nuclear eucariòtic i prendre consciència de les limitacions dels nostres coneixements i de la velocitat dels canvis
Conèixer les eines bàsiques de la tecnologia del DNA recombinant, de la clonació molecular i de la construcció de genoteques
Prendre consciència que descobriments en genètica molecular han fet possible el desenvolupament de la tecnologia del DNA recombinant
Ser capaç de discutir sobre els potencials efectes de mutacions en funció del lloc específic de la seqüència del DNA en el qual es produeixen
Ser capaç de discutir sobre la importància de mecanismes epigenètics que poden modular l'expressió de missatge de la seqüència del DNA. Conèixer que la metilació del DNA pot ser influenciada per factors ambientals com la dieta
 CE11 Conéixer com està organitzada la informació al genoma nuclear eucariòtic i prendre consciència de les liminitacions dels nostres coneixements i de la velocitat dels canvis
Conèixer les eines bàsiques de la tecnologia del DNA recombinant, de la clonació molecular i de la construcció de genoteques
Prendre consciència que descobriments en genètica molecular han fet possible el desenvolupament de la tecnolohgia del DNA recombinant
Ser capaç de discutir sobre la importància de mecanismes epigenètics que poden modular l'expresió del missatge de la seqüència del DNA. Coneixer que la metilació del DNA pot ser influenciada per factors ambientals com la dieta.
Type B Code Learning outcomes
Type C Code Learning outcomes

Contents
Topic Sub-topic
1. Introduction. Organization of the subject. Basic concepts of Molecular Genetics and Genetic Engineering.
2. Manipulation and characterization of DNA and RNA in vitro. Chemical synthesis of DNA and RNA. DNA and RNA polymerases. PCR. DNA and RNA sequencing. Restriction enzymes. Ligases. DNA marking. Southern, Northern. DNA microarrays.
3. Molecular Cloning in Escherichia coli. Vectors for the amplification and expression of genes in E. coli: plasmids and bacteriophages. Use of DNA in E. coli recombinant selection. Modification and expression of cloned genes. Genomic library and expression libraries. Expression of recombinant proteins in E. coli.
4. Genetic engineering in Saccharomyces cerevisiae yeast.
5. Classical genetic engineering in plants.
6. Classical genetic engineering in animal cells and organisms.
7. Editing eukaryotic genomes using CRISPR / Cas9 technology.
8. Manipulating gene expression in eukaryotes using small silencing RNAs.
9. Pluripotent and induced pluripotent stem cells.
10. Organizing the genome in model eukaryotic organisms.
11. Recombination in eukaryotic genomes.
12. Genetic variations and genetic diseases.

Planning
Methodologies  ::  Tests
  Competences (*) Class hours
Hours outside the classroom
(**) Total hours
Introductory activities
CE10
CE11
4 0 4
Lecture
CE10
CE11
24 36 60
Laboratory practicals
CE10
CE11
15 22.5 37.5
Problem solving, exercises
CE10
CE11
15 22.5 37.5
Personal attention
0 4 4
 
Mixed tests
CE10
CE11
2 4 6
 
(*) On e-learning, hours of virtual attendance of the teacher.
(**) The information in the planning table is for guidance only and does not take into account the heterogeneity of the students.

Methodologies
Methodologies
  Description
Introductory activities Activitats encaminades a prendre contacte i a recollir informació dels alumnes i presentació de l’assignatura.
Lecture Sessions on el professor explica el principal contingut de l'assignatura
Laboratory practicals Aplicar, a nivell pràctic, la teoria en un context determinat. Exercicis pràctics a través dels diferents laboratoris.
Problem solving, exercises Treball a classe i a casa sobre problemes relacionats amb l'assignatura. Qüestionaris al Moodle.
Personal attention Temps que cada professor té reservat per atendre i resoldre dubtes als alumnes.

Personalized attention
Description
Tutories virtuals a través del Moodle o correu electrònic. Tutories presencials al despatx 112 del departament de Bioquímica i Biotecnologia, amb cita prèvia mitjançant correu electrònic.

Assessment
Methodologies Competences Description Weight        
Laboratory practicals
CE10
CE11
S’avaluarà la preparació prèvia, participació activa, assistència i motivació, elaboració de informe de resultats i assoliment de coneixements mitjançant preguntes curtes o resolució de problemes 25%
Problem solving, exercises
CE10
CE11
Resolució de problemes a l'aula, participació en les sessions de problemes, resolució de qüestionaris al Moodle 25%
Mixed tests
CE10
CE11
Constarà de un examen del tipus proves mixtes, que inclourà tot el contingut treballat a l'assignatura 50%
Others  
 
Other comments and second exam session

Les pràctiques són d'assistència obligatòria. Per tal de ponderar tots els apartats, caldrà una nota mínima del 50% de cada part. La segona convocatòria constarà de una prova mixta on s'avaluaran tots els continguts de l'assignatura. Es requereix nota mínima del 50%. Es guardarà la nota obtinguda durant el curs de problemes i pràctiques.

Durant les proves d'avaluació, els telèfons mòbils, tablets i altres aparells que no siguin expressament autoritzats per la prova, han d'estar apagats i fora de la vista. La realització demostrativament fraudulenta d'alguna activitat avaluativa d'alguna assignatura tant en suport material com virtual i electrònic comporta a l'estudiant la nota de suspens d'aquesta activitat avaluativa. Amb independència d'això, davant la gravetat dels fets, el centre pot proposar la iniciació d'un expedient disciplinari, que serà incoat mitjançant resolució del rector o rectora.


Sources of information

Basic Primose S.B. and Twyman R.M, PRINCIPLES OF GENE MANIPULATION AND GENOMICS, Útima edición disponible en CRAI Sescelades,
Terry Brown, Gene cloning and DNA analysis, Útima edición disponible.,
Greg Gibson; Spencer V. Muse , A Primer of Genome Science , Útima edición disponible.,
Krebs, JE, Goldstein ES, Kilpatrick ST, Lewin's Essential GENES, Útima edición disponible.,

Complementary Peter Sudbery , Genética Molecular humana , Útima edición disponible en CRAI Sescelades. ,
Philip Meneely , Advanced Genetic Analysis , Útima edición disponible.,
Lewin B, GENES X, Útima edición disponible.,
Watson J.D. et al, BIOLOGÍA MOLECULAR DEL GEN, Útima edición disponible.,

Recommendations

Subjects that continue the syllabus
METHODOLOGY AND EXPERIMENTATION IN MOLECULAR BIOSCIENCES I/13214121
EPIGENETICS/13214216

Subjects that are recommended to be taken simultaneously
METHODOLOGY AND EXPERIMENTATION IN MOLECULAR BIOSCIENCES I/13214121

Subjects that it is recommended to have taken before
GENETICS/13214007
GENE EXPRESSION AND REPLICATION/13214102
(*)The teaching guide is the document in which the URV publishes the information about all its courses. It is a public document and cannot be modified. Only in exceptional cases can it be revised by the competent agent or duly revised so that it is in line with current legislation.