| Competències |
| Tipus A | Codi | Competències Específiques |
| Professionalitzador | ||
| Recerca | ||
| Tipus B | Codi | Competències Transversals |
| Comú | ||
| Tipus C | Codi | Competències Nuclears |
| Comú | ||
| Objectius d'aprenentatge |
| Objectius | Competències | ||
| Continguts |
| Tema | Subtema |
| 1. Introducció | 1.1-Desenvolupament de la assignatura 1.2-Desenvolupament de les pràctiques |
| 2. Estadistica bàsica | 2.1. Conceptes bàsics 2.2. Confirmació d'hipòtesis 2.3. Anàlisi de variança 2.4. Diferents tipus de test 2.5. Taules de contingència |
| 3. Ciencies ómiques: | 3.1 Genòmica 3.2 Transcriptòmica 3.3 Proteòmica 3.4 Metabolòmica 3.5 Biologia de sistemes |
| 4. Metabolómica | 4.1 Introducció a la resonancia magnética nuclear i l’espectrometria de mases 4.2 Diseny experimental 4.3. Processat de dades reals: detecció de pics, alineament i tractament estadístic (métodes multivariants i univariants) 4.4. Bases de dades i identificació de metabolits |
| 5. Metabolomica aplicada | 5.1 Diferenciació de cel.lules mare 5.2 Dolor neuropàtic 5.3 Diabetes i obesitat |
| Planificació |
| Metodologies :: Proves | |||||||||
| Competències | (*) Hores a classe | Hores fora de classe | (**) Hores totals | ||||||
| Activitats Introductòries |
|
1 | 0 | 1 | |||||
| Sessió Magistral |
|
26 | 48 | 74 | |||||
| Pràctiques a laboratoris |
|
15 | 37 | 52 | |||||
| Atenció personalitzada |
|
1 | 0 | 1 | |||||
| Proves de desenvolupament |
|
2 | 20 | 22 | |||||
| (*) En el cas de docència no presencial, són les hores de treball amb suport vitual del professor. (**) Les dades que apareixen a la taula de planificació són de caràcter orientatiu, considerant l’heterogeneïtat de l’alumnat | |||||||||
| Metodologies |
| Descripció | |
| Activitats Introductòries | Presentació de l’assignatura: objectius, metodologia docent i avaluació. |
| Sessió Magistral | Consistirà en sessions de 50 + 50 minuts (amb descans al mig) a on el professor exposarà la materia. Lluny de ser classes merament expositòries, es pretén generar amb el material un debat obert i animat sobre cada tema. |
| Pràctiques a laboratoris | Els alumnes assistiran a laboratori a on se'ls proposaran exercicis de estadistica i disseny experimental amb la plataforma de càlcul R. També se’ls introduirà en la comprensió d’articles científics de metabolómica i la seva discussió. |
| Atenció personalitzada |
| Atenció personalitzada |
|
|
| Avaluació |
| Descripció | Pes | ||
| Pràctiques a laboratoris | Serà de dos tipus: En grup (3 persones): escollir un article científic que el profesor oferirà i desenvolupar-ho (25%) Individual: programació amb R pel processat de dades metabolómiques (25%) |
50% | |
| Proves de desenvolupament | Serà de desenvolupament. En l’examen s’avaluarà la comprensió de la teoria i tindrà una part pràctica on els estudiants hauran de resoldre per escrit un cas real d’experiment metabolomic. | 50% | |
| Altres comentaris i segona convocatòria | |||
|
L'avaluació de la segona convocatoria serà: la teoria (50%), i les practiques a laboratori serà programació amb R pel processat de dades metabolómiques (50%). |
|||
| Fonts d'informació |
| Bàsica |
Gary J. Patti, Oscar Yanes & Gary Siuzdak, Metabolomics: the apogee of the omics trilogy, Nature Reviews Molecular Cell Biology 13, 263-269.
Yates JR, Park SK, Delahunty CM, Xu T, Savas JN, Cociorva D, Carvalho PC, Toward objective evaluation of proteomic algorithms, Nat Methods, 2012 Apr 27;9(5):455-6.
Schellenberger J, Que R, Fleming RM, Thiele I, Orth JD, Feist AM, Zielinski DC, Bordbar A, Lewis NE,, Quantitative prediction of cellular metabolism with constraint-based models: the COBRA Toolbox v2.0., Nat Protoc., 2011 Aug 4;6(9):1290-307
Oberhardt MA, Palsson BØ, Papin JA, Applications of genome-scale metabolic reconstructions, Mol Syst Biol, 2009;5:320 |
||||||||
| Complementària | |||||||||
| Recomanacions |
(*)La Guia docent és el document on es visualitza la proposta acadèmica de la URV. Aquest document és públic i no es pot modificar, llevat de casos excepcionals revisats per l'òrgan competent/ o degudament revisats d'acord amb la normativa vigent