DADES IDENTIFICATIVES 2020_21
Assignatura (*) TECNOLOGIA DE L'ADN RECOMBINANT Codi 19204117
Ensenyament
Grau de Biotecnologia (2009)
Cicle 1r
Descriptors Crèd. Tipus Curs Període
6 Obligatòria Tercer 1Q
Llengua d'impartició
Català
Departament Bioquímica i Biotecnologia
Coordinador/a
TERRA BARBADORA, XIMENA
Adreça electrònica ximena.terra@urv.cat
esther.rodriguez@urv.cat
marina.colom@urv.cat
marta.sierra@urv.cat
elia.navarro@urv.cat
Professors/es
TERRA BARBADORA, XIMENA
RODRÍGUEZ GALLEGO, ESTHER
COLOM PELLICER, MARINA
SIERRA CRUZ, MARTA
NAVARRO MASIP, ÈLIA
Web
Descripció general i informació rellevant <div>En aquesta assignatura les classes teòriques seran classes magistrals mixtes amb horari programat, és a dir, una part de l’alumnat assistirà presencialment a l’aula i la resta d’estudiants seguiran la classe simultàniament per videoconferència.</div><div><br /></div><p> En el cas d’emergència sanitària que requereixi confinar la població o que impliqui restriccions de mobilitat durant aquest curs, es procurarà adaptar l'activitat docent i l'avaluació. Si es produeix aquesta situació, s'informarà d'aquestes adaptacions a l’espai Moodle de cada assignatura.&nbsp;</p><div><br /></div><div>Metodologies i aplicacions de clonació amb vectors bacterians i de llevats. </div>

Competències
Tipus A Codi Competències Específiques
 A4 Conèixer i comprendre de forma integrada els organismes a nivell molecular, cel•lular i metabòlic
 A11 Aplicar adequadament la diversitat de tècniques i metodologies de DNA recombinant per a dissenyar estratègies d'enginyeria genètica cel•lular per a la producció de proteïnes homòlogues o heteròlogues, o de cèl•lules capaces d'actuar com biocatalitzadors
Tipus B Codi Competències Transversals
Tipus C Codi Competències Nuclears

Resultats d'aprenentage
Tipus A Codi Resultats d'aprenentatge
 A4 Utilitzar les eines bioinformàtiques per a: a) analitzar estructures i seqüències de proteïnes i àcids nucleics, i b) cercar informació en les principals bases de dades biològiques i bibliogràfiques
Conèixer eines avançades de l'enginyeria genètica, tant en sistemes procariotes com eucariotes.
Apreciar la velocitat dels canvis en els coneixements i eines de la tecnologia del ADN recombinant.
Adquirir experiència en l'exposició oral i defensa d'un treball.
 A11 Utilitzar les eines bioinformàtiques per a: a) analitzar estructures i seqüències de proteïnes i àcids nucleics, i b) cercar informació en les principals bases de dades biològiques i bibliogràfiques
Conèixer els aspectes vinculats al cultiu de cèl·lules in vitro, a nivell pràctic, teòric i les seves aplicacions al camp de la biotecnologia
Conèixer i dominar les tècniques analítiques instrumentals que s'apliquen a biotecnologia.
Conèixer i dominar les tècniques bàsiques instrumentals de bioquímica i biologia mol·lecular
Conèixer eines avançades de l'enginyeria genètica, tant en sistemes procariotes com eucariotes.
Apreciar la velocitat dels canvis en els coneixements i eines de la tecnologia del ADN recombinant.
Adquirir experiència en l'exposició oral i defensa d'un treball.
Tipus B Codi Resultats d'aprenentatge
Tipus C Codi Resultats d'aprenentatge

Continguts
Tema Subtema
1. Introducció. Introducció a l’enginyeria genètica als conceptes bàsics de clonatge. DNA recombinant; vectors i eines; incorporació de DNA a l’hoste, tècniques bàsiques (PCR, electroforesis...).
2. Vectors per a procariotes: Plasmidis i bacteriòfags. Característiques bàsiques dels vectors plasmidis i bacteriòfags. Selecció. Millora dels vectors bàsics. Plasmidis pBR322 i pUC. Vectors derivats del fag lambda d’inserció i de substitució. Vectors avançats. Aplicacions: Phage Display.
3. Manipulació del DNA. Purificació del DNA. Tall i unió: enzims de restricció, lligases, altres enzims usats en enginyeria genètica.
4. Introducció del DNA a l’hoste i selecció de recombinants. Transformació per mètodes químics i físics, mètode del clorur de calci, electroporació. Virus. Identificació dels organismes transformats.
5. Llibreries gèniques. Construcció de genoteques.
6. Clonatge en llevats. Clonatge en S. cerevisiae. Vectors: vectors d’integració cromosòmica (YIp) i vectors de replicació autònoma (YEp, YRp, YCp, YAC). Introducció de DNA en llevats. Expressió de proteïnes recombinants. Yeast cell surface display. Aplicacions: Yeast Two Hybrid, Yeast Three Hybrid.
7. Enginyeria genètica en cèl·lules animals. Transfecció transitòria i estable. Estratègies de transfecció. Mètodes de selecció. Vectors: plasmidis no replicatius, plasmidis amb replicons vírics, vectors vírics (retrovirus, lentivirus, adenovirus). Cèl•lules empaquetadores. Expressió de proteïnes. Gene silencing per RNA d’interferència. Tècnica CRISPR/Cas9.
TEMARI PRÀCTIQUES CLONATGE DEL GENOMA DEL BACTERIÒFAG LAMBDA AL VECTOR pUC18 D’AMPLIFICACIÓ A E. COLI

Planificació
Metodologies  ::  Proves
  Competències (*) Hores a classe
Hores fora de classe
(**) Hores totals
Activitats Introductòries
A4
3 0 3
Sessió Magistral
A4
A11
25 40 65
Pràctiques a laboratoris
A4
A11
30 37 67
Treballs
A4
A11
2 10 12
Atenció personalitzada
A4
1 0 1
 
Proves mixtes
2 0 2
 
(*) En el cas de docència no presencial, són les hores de treball amb suport vitual del professor.
(**) Les dades que apareixen a la taula de planificació són de caràcter orientatiu, considerant l’heterogeneïtat de l’alumnat

Metodologies
Metodologies
  Descripció
Activitats Introductòries Activitats encaminades a prendre contacte i a recollir informació dels alumnes i presentació de l’assignatura.

Sessió Magistral Exposició dels continguts de l'assignatura.
Pràctiques a laboratoris Aplicar, a nivell pràctic, la teoria d’un àmbit de coneixement en un context determinat. Exercicis pràctics a través dels diferents laboratoris.
Treballs Seminari: Exposició oral per part dels alumnes d'un tema concret o d'un treball (prèvia presentació escrita). Treball en profunditat d'un tema (monogràfic). Ampliació i relació dels continguts donats a les sessions magistrals amb el quefer professional.

Informe de pràctiques: recopilació de resultats i conclusions de les pràctiques de laboratori.
Atenció personalitzada Temps reservat per atendre i resoldre dubtes als alumnes.

Atenció personalitzada
Descripció
Temps reservat per atendre i resoldre dubtes als alumnes. Concertar cita via e-mail.

Avaluació
Metodologies Competències Descripció Pes        
Pràctiques a laboratoris
A4
A11
Test individual de les pràctiques (20%)

Informe en grup de les pràctiques (15%).

El comportament, l'interès i l'assistència obligatòria es valoraran (5%).
40%
Treballs
A4
A11
Seminaris en grup (10%). 10%
Proves mixtes
Examen (50%) 50%
Altres  
 
Altres comentaris i segona convocatòria

L'assistència a les pràctiques de laboratori és obligatòria. Cal justificar les faltes.

Per tal de ponderar totes les activitats amb pes a la nota, caldrà una nota mínima de 5/10 de la part de pràctiques i de 5/10 de l'examen.

Segona convocatòria: es pot recuperar l'examen de teoria i/o el test individual de pràctiques. Es guardarà la nota de l'informe en grup de les pràctiques i del seminari en grup.

Durant les proves d'avaluació, els telèfons mòbils, tablets i altres aparells que no siguin expressament autoritzats per la prova, han d'estar apagats i fora de la vista. La realització demostrativament fraudulenta d'alguna activitat avaluativa d'alguna assignatura tant en suport material com virtual i electrònic comporta a l'estudiant la nota de suspens d'aquesta activitat avaluativa. Amb independència d'això, davant la gravetat dels fets, el centre pot proposar la iniciació d'un expedient disciplinari, que serà incoat mitjançant resolució del rector o rectora.


Fonts d'informació

Bàsica

Joseph Sambrook, David W Russell, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd edition, Cold Spring Harbour Laboratory Press, 2001

La bibliografia científica més rellevant pel projecte es trobarà disponible a l’espai Moodle de l’assignatura.

Tanmateix es faran servir catàlegs de proveïdors de material biològic, enzims, reactius i aparells com a font d’informació especialitzada i específica per cada experiment.

Complementària

Recomanacions

Assignatures que es recomana cursar simultàniament
GENÈTICA MOLECULAR/19204113

Assignatures que es recomana haver cursat prèviament
GENÈTICA/19204007
ESTRUCTURA I FUNCIÓ DE BIOMOLÈCULES/19204107
EXPRESSIÓ I REPLICACIÓ GÈNIQUES/19204102
(*)La Guia docent és el document on es visualitza la proposta acadèmica de la URV. Aquest document és públic i no es pot modificar, llevat de casos excepcionals revisats per l'òrgan competent/ o degudament revisats d'acord amb la normativa vigent