DADES IDENTIFICATIVES 2016_17
Assignatura (*) ENGINYERIA DE PROTEÏNES Codi 19204222
Ensenyament
Grau de Biotecnologia (2009)
Cicle 1r
Descriptors Crèd. Tipus Curs Període
3 Optativa 1Q
Llengua d'impartició
Català
Departament Bioquímica i Biotecnologia
Coordinador/a
PUJADAS ANGUIANO, GERARD
Adreça electrònica gerard.pujadas@urv.cat
Professors/es
PUJADAS ANGUIANO, GERARD
Web http://moodle.urv.cat
Descripció general i informació rellevant L'assignatura dóna les bases (teòriques i pràctiques) per a entendre quines són les propietats d'una proteïna susceptibles de ser millorades, com fer aquestes millores i predir l'efecte dels canvis realitzats en la seqüència proteica sobre la seva estructura.

Competències
Tipus A Codi Competències Específiques
 A8 Analitzar adequadament dades i resultats experimentals propis dels àmbits de Biotecnologia amb tècniques estadístiques, i saber-los interpretar
Tipus B Codi Competències Transversals
Tipus C Codi Competències Nuclears

Resultats d'aprenentage
Tipus A Codi Resultats d'aprenentatge
 A8 Utilitzar diferents bases de dades (e.g., PDB, SCOP, …) per tal d'esbrinar quines són les principals característiques de l'estructura d'una determinada proteïna
Utilitzar programes informàtics per tal d'analitzar l'estructura de les proteïnes
Tipus B Codi Resultats d'aprenentatge
Tipus C Codi Resultats d'aprenentatge

Continguts
Tema Subtema
1. Estructura tridimensional de les proteïnes 1.1. El binomi SPdbV/SwissModel com a eines computacionals en el camp de l'enginyeria de proteïnes

1.2. Proteïnes amb estructura coneguda: anàlisi de la seva estructura 3D
2. Fonaments de l'enginyeria de proteïnes. 2.1. Aplicació de l'enginyeria de proteïnes per tal d'introduir mutacions que millorin la termostabilitat d'un enzim.

2.2. Aplicació de l'enginyeria de proteïnes per tal d'introduir mutacions que adaptin l'activitat d'un enzim a baixes temperatures.
3. Disseny de novo de proteïnes

Planificació
Metodologies  ::  Proves
  Competències (*) Hores a classe
Hores fora de classe
(**) Hores totals
Activitats Introductòries
1 0 1
Sessió Magistral
A8
10 15 25
Pràctiques a través de TIC en aules informàtiques
A8
20 25 45
Atenció personalitzada
2 0 2
 
Proves objectives de preguntes curtes
A8
2 0 2
 
(*) En el cas de docència no presencial, són les hores de treball amb suport vitual del professor.
(**) Les dades que apareixen a la taula de planificació són de caràcter orientatiu, considerant l’heterogeneïtat de l’alumnat

Metodologies
Metodologies
  Descripció
Activitats Introductòries Presentació de l'assignatura (amb detall de la metodologia docent que s'emprarà i dels criteris d'avaluació)
Sessió Magistral Explicacions teòriques que es realitzaran a l'aula d'informàtica i que aniran seguides d'un exercici pràctic (no avaluable) per part dels alumnes o de la visualització d'un vídeo per tal d'exemplificar les explicacions teòriques
Pràctiques a través de TIC en aules informàtiques Exercici pràctic on, en grups de tres o quatre alumnes, es realitzarà un exercici pràctic d'anàlisi per mètodes computacionals de l'estructura d'una proteïna i se'ls hi demanarà que, en funció d'aquesta anàlisi, suggereixin quins canvis es podrien realitzar en la seva seqüència per tal de millorar alguna propietat (e.g., termoestabilitat, etc.) respecte a la proteïna nativa
Atenció personalitzada Resposta als dubtes dels alumnes a través de l'enviament de correus a l'adreça enginyeria.proteines@estudiants.urv.cat. Aquesta adreça correspon a una llista de discussió de l'assignatura a la qual estan subscrits tots els seus alumnes (o sigui, que tots poden enviar correus amb dubtes a la llista i tots reben els dubtes/respostes que s'hi envien).

Els correus enviats a l'adreça enginyeria.proteines@estudiants.urv.cat queden desats també a l'adreça https://llistes.urv.cat/pipermail/enginyeria.proteines/

Atenció personalitzada
Descripció
Resposta als dubtes dels alumnes a través de l'enviament de correus a l'adreça enginyeria.proteines@estudiants.urv.cat. Aquesta adreça correspon a una llista de discussió de l'assignatura a la qual estan subscrits tots els seus alumnes (o sigui, que tots poden enviar correus amb dubtes a la llista i tots reben els dubtes/respostes que s'hi envien). Els alumnes també poden consultar els seus dubtes directament al professor anant al seu despatx (el 106) durant les hores de visita (veure web institucional).

Avaluació
Metodologies Competències Descripció Pes        
Pràctiques a través de TIC en aules informàtiques
A8
Exercici pràctic on, en grups de tres o quatre alumnes, es realitzarà un exercici pràctic d'anàlisi per mètodes computacionals de l'estructura d'una proteïna i se'ls hi demanarà que, en funció d'aquesta anàlisi, suggereixin quins canvis es podrien realitzar en la seva seqüència per tal de millorar alguna propietat (e.g., termoestabilitat, etc.) respecte a la proteïna nativa Aquestes pràctiques poden aportar un màxim de 5 punts sobre 10 a la nota final de l'assignatura.
Proves objectives de preguntes curtes
A8
Una única prova on l'alumne haurà de respondre a tot un seguit de preguntes objectives curtes que demostrin quin és el nivell d'aprofitament individual que ha assolit en l'assignatura Aquesta prova objectiva pot aportar un màxim de 5 punts sobre 10 a la nota final de l'assignatura.
Altres  
 
Altres comentaris i segona convocatòria

En la segona convocatòria sols es realitzarà la part equivalent a les proves objectives de preguntes curtes de la primera convocatòria (amb idèntic pes en la nota final). Això vol dir que la nota obtinguda en la part de "Pràctiques a través de TIC en aules informàtiques" de la primera convocatòria serà vàlida també per a la segona convocatòria.

Durant les proves d'avaluació, els telèfons mòbils, tablets i altres aparells que no siguin expressament autoritzats per la prova, han d'estar apagats i fora de la vista. La realització demostrativament fraudulenta d'alguna activitat avaluativa d'alguna assignatura tant en suport material com virtual i electrònic comporta a l'estudiant la nota de suspens d'aquesta activitat avaluativa. Amb independència d'això, davant la gravetat dels fets, el centre pot proposar la iniciació d'un expedient disciplinari, que serà incoat mitjançant resolució del rector o rectora.


Fonts d'informació

Bàsica Lesk, Arthur M., Introduction to protein science: architecture, function, and genomics, 2nd ed., 2010
Edited by Sheldon J. Park, Jennifer R. Cochran, Protein engineering and design, , 2010
Carlos Gómez-Moreno Calera y Javier Sancho Sanz, Estructura de proteínas, , 2003

Complementària

Recomanacions


Assignatures que es recomana haver cursat prèviament
ESTRUCTURA I FUNCIÓ DE BIOMOLÈCULES/19204107
(*)La Guia docent és el document on es visualitza la proposta acadèmica de la URV. Aquest document és públic i no es pot modificar, llevat de casos excepcionals revisats per l'òrgan competent/ o degudament revisats d'acord amb la normativa vigent