DADES IDENTIFICATIVES 2007_08
Assignatura ECOLOGÍA DE MICROORGANISMES DURANT LA FERMENTACIÓ VÍNICA; APLICACIÓ DE TÈCNIQUES MOLECULARS Codi 195131211
Ensenyament
Enologia (2006)
Cicle 2on
Descriptors Crèd. Tipus Curs Període
5 Optativa Únic anual
Llengua d'impartició
Castellà
Departament Bioquímica i Biotecnologia
Coordinador/a
BORDONS DE PORRATA- DORIA, ALBERT
Adreça electrònica montserrat.poblet@urv.cat
cristina.reguant@urv.cat
albert.bordons@urv.cat
josemanuel.guillamon@urv.cat
mjesus.torija@urv.cat
Professors/es
POBLET ICART, MARIA MONTSERRAT
REGUANT MIRANDA, CRISTINA
BORDONS DE PORRATA- DORIA, ALBERT
GUILLAMÓN NAVARRO, JOSÉ MANUEL
TORIJA MARTÍNEZ, MARÍA JESÚS
Web
Descripció general i informació rellevant Coneixement de les tècniques moleculars d’identificació de microorganismes vínics i la seva aplicació al seguiment dels processos fermentatius.

Competències
Tipus A Codi Competències Específiques
  Comú
  AC2 Coneixements científics i tècnics dels processos d’elaboració del vi.
  Professionalitzador
  Recerca
  AR2 Perfecta capacitació per incorporar-se productivament a un departament universitari per tal de desenvolupar les tasques pròpies d’una Tesis doctoral.
  AR3 La concepció, planificació, execució i direcció de projectes de R+D+I.
  AR4 L’excel•lència en l’estudi i coneixement de l’àmbit de recerca en enologia.
  AR5 La realització de recerques bibliogràfiques exhaustives en temes enològics altament especialitzats.
  AR6 Conèixer i comprendre els sistemes d’anàlisi estadística, tractament gràfic de dades i gestió d’informació aplicats al camp de la recerca en enologia.
  AR7 La presentació de resultats en format de literatura científica, d’acord amb els estàndards comunament acceptats.
  AR8 L’avaluació crítica de resultats de recerca enològica, pròpia o aliena.
Tipus B Codi Competències Transversals
  Comú
  BC1 Creativitat. Desenvolupar idees i projectes originals.
  BC2 Treballar autònomament amb iniciativa.
  BC3 Flexibilitat. Disponibilitat per a l’adaptació en ambients canviants.
  BC4 Resoldre problemes de manera efectiva.
  BC6 Actuar amb un esperit crític i responsable.
  BC11 Assertivitat. Comunicar de manera clara i sense ambigüitats tant a audiències expertes com no expertes.
  BC12 Aprendre a aprendre.
  BC13 Planificació i organització.
Tipus C Codi Competències Nuclears
  Comú
  CC1 Domini de l’expressió i la compressió del/s idioma/es estrangers per al desenvolupament professional derivat del curs de postgrau.
  CC2 Ús de les eines específiques de TIC per al desenvolupament professional derivat del curs de postgrau.
  CC4 Desenvolupament d’habilitats informacionals.

Objectius d'aprenentatge
Objectius Competències
Coneixement de les principals tècniques moleculars d'identificació de microorganismes. AC2
AR2
AR3
AR4
AR5
AR7
AR8
BC1
BC2
BC3
BC4
BC6
BC11
BC12
BC13
CC1
CC2
CC4
Identificació i ecologia de llevats. AC2
AR2
AR3
AR4
AR5
AR7
AR8
BC1
BC2
BC3
BC4
BC6
BC11
BC12
BC13
CC1
CC2
CC4
Identificació i ecologia de bacteris làctics. AC2
AR2
AR3
AR4
AR5
AR7
AR8
BC1
BC2
BC3
BC4
BC6
BC11
BC12
BC13
CC1
CC2
CC4
Identificació i ecologia de bacteris acètics. AC2
AR2
AR3
AR4
AR5
AR7
AR8
BC1
BC2
BC3
BC4
BC6
BC11
BC12
BC13
CC1
CC2
CC4
Interaccions entre microorganismes. AC2
AR2
AR3
AR4
AR5
AR6
AR7
AR8
BC1
BC2
BC3
BC4
BC6
BC11
BC12
BC13
CC1
CC2
CC4

Continguts
Tema Subtema
1. Aplicación de técnicas moleculares en la identificación de microorganismos 1.1. Identificación de levaduras: Secuenciación y análisis de genes ribosomales y secuenciación de otros genes como la actina y la citocormo c oxidasa.
1.2. Identificación de levaduras a nivel de cepa: Análisis de restricción del mtDNA, Electroforesis de campo pulsante, elementos delta y RAPDs.
1.3. Identificación de bacterias lácticas.
1.4. Identificación de bacterias acéticas.
2. Interacción levadura-levadura durante la fermentación alcohólica, Saccharomyces vs. no-Saccharomyces 2.1. Géneros y especies más abundantes en las distintas fases de la fermentación alcohólica.
2.2. Diversidad de cepas de Saccharomyces cerevisiae.
2.3. Influencia de las diferentes prácticas enológicas sobre las poblaciones de levaduras (prácticas de viticultura, temperatura de fermentación, inoculación, SO2, etc.).
3. Interacción levaduras-bacterias lácticas durante la fermentación alcohólica 3.1. Diversidad de géneros y especies de bacterias lácticas durante la fermentación alcohólica.
3.2. Métodos de estudio del antagonismo entre S. cerevisiae y Oenococcus oeni.
3.3. Influencia de la cepa de levadura y de las diferentes prácticas enológicas (temperatura, aireación, SO2, etc) sobre la fermentación maloláctica.
4. Interacción levaduras-bacterias acéticas durante la fermentación alcohólica 4.1. Diversidad de géneros y especies de bacterias acéticas durante la fermentación alcohólica.
4.2. Crecimiento de las bacterias acéticas durante la fermentación alcohólica.
4.3. Influencia de las diferentes prácticas enológicas sobre el desarrollo de las bacterias acéticas. Impacto sobre la calidad del vino.
5. Interacción entre bacterias lácticas y bacterias acéticas durante la fermentación maloláctica Interacción entre bacterias lácticas y bacterias acéticas durante la fermentación maloláctica.
6. Bioquímica y fisiología de las levaduras vínicas 6.1.- Descripción bioquímica del proceso de fermentación alcohólica y de su importancia para la generación de productos importantes para las propiedades del vino.
6.2.- Aspectos relevantes del metabolismo de compuestos nitrogenados y su relación con las propiedades organolépticas del vino
6.3- Descripción de las condiciones de estrés que afectan a las levaduras durante las diferentes etapas de producción del vino
6.4.- Estudio de la respuesta a estrés en la levadura Saccharomyces cerevisiae y en particular en cepas vínicas.

Planificació
Metodologies  ::  Proves
  Competències (*) Hores a classe Hores fora de classe (**) Hores totals
Activitats Introductòries
2 0 2
 
Sessió Magistral
8 8 16
Pràctiques a laboratoris
20 20 40
Debats
7 7 14
Presentacions / exposicions
7 7 14
Treballs
0 18 18
Seminaris
6 6 12
 
Atenció personalitzada
1 0 1
 
Proves orals
1 1 2
Proves de Desenvolupament
3 3 6
 
(*) En el cas de docència no presencial, són les hores de treball amb suport vitual del professor.
(**) Les dades que apareixen a la taula de planificació són de caràcter orientatiu, considerant l’heterogeneïtat de l’alumnat

Metodologies
Metodologies
  Descripció
Activitats Introductòries Presentació de l’assignatura.
Sessió Magistral Explicació dels continguts teòrics.
Pràctiques a laboratoris Aplicació pràctica de les tècniques d’identificació de microorganismes.
Debats Discussió sobre temes concrets relacionats amb els continguts de l’assignatura via internet.
Presentacions / exposicions Exposició oral per part del alumnes d'un tema concret o d'un treball (prèvia presentació escrita).
Treballs Recensió d’articles científics.
Seminaris Aprofundiment sobre un tema de manera monogràfica.

Atenció personalitzada
 
Sessió Magistral
Pràctiques a laboratoris
Debats
Presentacions / exposicions
Seminaris
Treballs
Atenció personalitzada
Descripció
L’alumne pot contactar vía correu electrònic amb els professors o bé durant els periodes d’atenció programats.

Avaluació
  Descripció Pes
Presentacions / exposicions -Presentació en sessió pública d'una revisió bibliogràfica d'un tema específic escollit per l'alumne (amb conformitat de tutor) relacionat amb temes del curs (3a part), i debat responent a preguntes de professors.

-Presentació en sessió pública de respostes de lectura crítica d'articles sobre temes del curs (2a part)
20%







10% (Veure apartat Proves de Desenvolupament)
Treballs Memòria escrita de revisió bibliogràfica del tema presentat anterior (3a part) 20%
Seminaris Participació en els seminaris sobre els diversos temes. Es tindrà en compte per a la nota final 5%
Proves orals Veure apartat d'exposicions Veure apartat d'exposicions
Proves de Desenvolupament -Respostes per escrit (e-mail) a preguntes sobre informació bibliografia deixada per professors sobre cada tema (1a part)

-Respostes per escrit (e-mail) a preguntes de lectura crítica d'articles sobre temes del curs (2a part)
25%




20%
 
Altres comentaris i segona convocatòria

Fonts d'informació

Bàsica
  • DELFINI, C. & V.F. FORMICA. Wine Microbiology, Science and Technology. Ed. Marcel Dekker, Nueva York, 2001.
  • FLEET, G.H. "Wine microbiology and biotechnology". Harwood academic publishers. Switzerland, 1993.
  • FUGELSANG, K.C. Wine microbiology. Ed. Chapman and Hall Enology Library, New York, 1997.
  • KURTZMAN, C P & FELL, J W. The yeasts: A taxonomic study Ed. Elsevier Science Pule. Co., Amsterdam, 1998.
  • RIBEREAU-GAYON, P, DUBOURDIEU, D, DONECHE, B, LONVAUD, A. Traité d’oenologie. Microbiologie du vin. Ed. Dunod, Paris, 1998. (versión en Inglés, 2000).
  • Yeast-Bacteria Interactions. Lallemand Technical Meetings. Biarritz, 2002.
  • Querol A and Ramón D (1996). The application of molecular techniques in wine microbiology. Trends Food Sci Technol 7:73-78.
Complementària
  • A. Ruiz, M. Poblet, A. Mas y J.M. Guillamón. (2000) Identification of acetic acid bacteria by RFLP of the PCR-amplified 16S rDNA and 16S-23S rDNA intergenic spacers. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 50: 1981-1987.
  • G Zapparoli, C Reguant, A Bordons, S Torriani, F Dellaglio. (2000) Genomic DNA fingerprinting of Oenococcus oeni strains by pulsed-field gel electrophoresis and randomly PCR-amplified polymorphic DNA. Current Microbiology 40: 351-355.
  • M.J. Torija, N. Rozès, M. Poblet, N. Rozès, J.M. Guillamón y A. Mas. (2001) Yeast population dynamics in spontaneous fermentations: comparisons between two different wine producing areas over a period of three years. Antonie van Leeuwenhoek Int. J. G. 79: 345-352.
  • G Beltran, MJ Torija, M Novo, N Ferrer, M Poblet, JM Guillamon, N Rozes y A Mas. (2002) Analysis of yeast populations during alcoholic fermentation: a six year follow-up study. Systematic and Applied Microbiology 25: 287-293.
  • J Sabaté, J Cano, B Esteve-Zarzoso y JM Guillamón. (2002) Isolation and identification of yeasts associated with vineyard and winery by RFLP analysis of ribosomal genes and mitochnrial DNA. Microbiological Research 157: 1-8.
  • A Mas, A. González, N. Hierro, M Poblet, JM Guillamón y N Rozès. (2003) Bacterias acéticas durante la fermentación vínica: Interacciones con otros microorganismos. 3: 27-30.
  • C Reguant, A Bordons. (2003) Typification of Oenococcus oeni strains by multiplex RAPD-PCR and study of population dynamics during malolacic fermentation. Journal of Applied Microbiology, 95, 2: 344-353.
  • Á. González, N. Hierro, M. Poblet, N. Rozès, A. Mas y J. M. Guillamón. Application of molecular methods for the differentiation of acetic acid bacteria in a red wine fermentation. Journal of Applied Microbiology. (En prensa).
  • Ivorra, C.; Pérez-Ortín, J.E. y Del Olmo, M. (1999). Reverse correlation of stress-resistance ability and stuck fermentations in wine yeasts. A molecular study. Biotechnol. & Bioeng. 64, 698-708.
  • Carrasco, P., Querol, A. y del Olmo, M. (2001) Analysis of the stress resistance of comercial wine yeast strains. Arch. Microbiol. 175, 450-457.
  • Querol, A., E. Barrio, T. Huerta, and D. Ramón. 1992. Molecular monitoring of wine fermentations conducted by active dry yeast strains. Appl. Environ. Microbiol. 58:2948-2953.
  • Querol A, Barrio E, and Ramón D (1994). Population dynamics of natural Saccharomyces strains during wine fermentation. Int J Food Microbiol 21:315-323.
  • Aranda, A., A. Querol, and M. del Olmo. 2002. Correlation between acetaldehyde and ethanol resistance and expression of HSP genes in yeast strains isolated during the biological aging of sherry wines. Arch Microbiol. 177:304-312.
Recomanacions