| Grado en Química (2009) |
 Asignaturas |
| MODELIZACIÓN MOLECULAR |
| Contenidos |
| DATOS IDENTIFICATIVOS | 2022_23 |
| Asignatura | MODELIZACIÓN MOLECULAR | Código | 13204205 | |||||
| Titulación |
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Ciclo | 1º | |||||
| Descriptores | Cr.totales | Tipo | Curso | Periodo | ||||
| 3 | Optativa | Cuarto | 1Q |
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| Competencias | Resultados de aprendizaje | Contenidos |
| Planificación | Metodologías | Atención personalizada |
| Evaluación | Fuentes de información | Recomendaciones |
| tema | Subtema |
| EJERCICIO 1 | Construcción y diseño de diversas estructuras moleculares bioquímicas, orgánicas e inorgánicas. Recursos web |
| EJERCICIO 2 | Optimización de la estructura y la energía del 2-buteno (isómero cis y trans). Optimización de la geometría de una macromolécula: la proteína LISOZYME |
| EJERCICIO 3 | Análisis conformacional de un polipéptido (gráfico Ramachandran) y / o de un polímero |
| EJERCICIO 4 | Simulación dinámica de una proteína e interacción con un óxido molecular |
| Tema 1. Introducción | Definiciones. Evolución histórica. Aplicaciones de la Modelización Molecular |
| Tema 2. Software de disseño molecular | Sistemas de coordenadas. Constructores y visualizadores moleculares. |
| Tema 3. Cálculo de propiedades moleculares: estructura y energía | Superficies de energía potencial (PES). Puntos estacionaris.Teoria del estado de transición (TST). Algoritmos para las búsquedas de mínimos y estados de transición. Funciones termodinámicas. |
| Tema 4. Métodos clásicos: la energía de la mecánica molecular | Modelos clásicos. Esquemas de parametrización |
| Tema 5. Simulaciones dinámicas | Dinámica Molecular clásica. Métodos Monte Carlo |
| Tema 6. Métodos Multicapa | QM/MM. ONIOM. Solvatación |
