2014_15
Guia docent 
Facultat de Química
A A A 
català 
Grau de Química (2009)
 Assignatures
  MODELITZACIÓ MOLECULAR
   Continguts
Tema Subtema
EXERCICI 1 Construcció i disseny de diverses estructures moleculars bioquímiques, orgàniques i inorgàniques. Recursos web
EXERCICI 2 Optimització de l’estructura i l’energia del 2-butè (isòmer cis i trans). Optimització de la geometria d’una macromolècula: la proteïna LISOZYME
EXERCICI 3 Anàlisi conformacional d'un polipèptid (gràfic Ramachandran) i/o d'un polímer
EXERCICI 4 Simulació dinàmica d’una proteïna i interacció amb un òxid molecular
EXERCICI 5 Determinació mitjançant el mètode ONIOM de l'etapa clau d’un cicle catalític: hidroformilació d’alquens and complexos organometàl•lics de rodi
Tema 1. Introducció Definicions. Evolució històrica. Aplicacions de la Modelització Molecular
Tema 2. Software de disseny molecular Sistemes de coordenades. Constructors i visualitzadors moleculars.
Tema 3. Càlcul de propietats moleculars: estructura i energia Superfícies d'energia potencial (PES). Punts estacionaris.Teoria de l’estat de transició (TST). Algoritmes per les cerques de mínims i estats de transició. Funcions termodinàmiques.
Tema 4. Mètodes clàssics: l’energia de la mecànica molecular Models clàssics. Esquemes de parametrització
Tema 5. Càlcul de propietats dinàmiques Dinàmica molecular. Mètode Monte-Carlo. Anàlisi conformacional
Tema 6. Reactivitat: l’energia de la mecànica quàntica Mètodes quàntics. Hartree-Fock i mètodes semiempírics. Correlació electrònica. Mètodes post-Hartree-Fock i DFT.
Tema 7. Mètodes Multicapa QM/MM. ONIOM. Solvatació