| Guia docent Facultat de Química |
català |
| Grau en Química (2009) |
 Assignatures |
| MODELITZACIÓ MOLECULAR |
| Continguts |
| DADES IDENTIFICATIVES | 2022_23 |
| Assignatura | MODELITZACIÓ MOLECULAR | Codi | 13204205 | |||||
| Ensenyament |
|
Cicle | 1r | |||||
| Descriptors | Crèd. | Tipus | Curs | Període | ||||
| 3 | Optativa | Quart | 1Q |
|||||
| Competències | Resultats d'aprenentage | Continguts |
| Planificació | Metodologies | Atenció personalitzada |
| Avaluació | Fonts d'informació | Recomanacions |
| Tema | Subtema |
| EXERCICI 1 | Construcció i disseny de diverses estructures moleculars bioquímiques, orgàniques i inorgàniques. Recursos web |
EXERCICI 2 |
Optimització de l’estructura i l’energia del 2-butè (isòmer cis i trans). Optimització de la geometria d’una macromolècula: la proteïna LISOZYME |
EXERCICI 3 |
Anàlisi conformacional d'un polipèptid (gràfic Ramachandran) i/o d'un polímer |
EXERCICI 4 |
Simulació dinàmica d’una proteïna i interacció amb un òxid molecular |
Tema 1. Introducció |
Definicions. Evolució històrica. Aplicacions de la Modelització Molecular |
| Tema 2. Software de disseny molecular | Sistemes de coordenades. Constructors i visualitzadors moleculars. |
| Tema 3. Càlcul de propietats moleculars: estructura i energia | Superfícies d'energia potencial (PES). Punts estacionaris.Teoria de l’estat de transició (TST). Algoritmes per les cerques de mínims i estats de transició. Funcions termodinàmiques. |
| Tema 4. Mètodes clàssics: l’energia de la mecànica molecular | Models clàssics. Esquemes de parametrització |
| Tema 5. Simulacions dinàmiques | Dinàmica Molecular clàssica. Mètode Monte Carlo. . |
| Tema 6. Mètodes Multicapa | QM/MM. ONIOM. Solvatació |
